Аэропорт Пуэрто-Лемпира обслуживает только внутренние рейсы. Регистрация пассажиров и оформление багажа для самолетов внутренних линий обычно начинается за 2 часа и завершается за 40 минут до вылета.
Чтобы пройти регистрацию на рейс в аэропорту, понадобятся билет и паспорт. Если пассажир приобрел электронный билет, для регистрации и посадки на рейс ему понадобится только паспорт.