Аэропорт Сан-Хуан принимает только внутренние рейсы. Регистрация пассажиров и оформление багажа для рейсов внутренних линий обычно начинается за 2 часа и завершается за 40 минут до времени вылета.
Чтобы пройти регистрацию на рейс в аэропорту, надо предъявить билет и паспорт. Если пассажир купил электронный билет, для регистрации и посадки в самолет ему понадобится только паспорт.