Аэропорт Кокосовые Острова обслуживает как внутренние, так и международные рейсы. Регистрация пассажиров и оформление багажа для самолетов внутренних линий обычно начинается за 2 часа и заканчивается за 40 минут до времени вылета. У пассажиров международных линий регистрация начинается за 2 часа 30 минут и заканчивается за 40 минут до вылета.
Чтобы зарегистрироваться на рейс в аэропорту, надо предъявить билет и паспорт. Если пассажир приобрел электронный билет, для регистрации и посадки на рейс ему понадобится только паспорт.